掩盖症状容易造成误诊  如果在未经医生诊治之前滥用止痛药，可掩盖疾病特有的症状，给医生诊断带来困难。同时，还可造成症状（疼痛）一时减轻的假象，误认为病情好转，容易贻误病机，导致严重后果。
    成瘾  一些止痛药尤其是高效止痛药，长期应用形成药瘾，对此种药物产生依赖性，给病人造成极大的痛苦。
    过敏  许多解热止痛药可引起人体过敏性哮喘、荨麻疹、过敏性鼻炎等。
损害造血系统及血细胞  一些止痛药（阿斯匹林、安基比林等）长期或过量应用，可对造血系统及血细胞造成损害，引起粒细胞减少，血小板减少，甚至会诱发再生障碍性贫血等疾病。
    伤胃  多种止痛药若长期或超量应用，可致胃粘膜损害，引起胃出血，尤以阿斯匹林为甚。
    伤肾  长期或超量服用含有非那西丁的解热止痛合剂，可引起以肾乳头坏死及间质炎性变化为特点的解热止痛药肾病。
    诱发某些肿瘤  一些止痛药长期应用，对肾乳头癌有诱发作用。
    损害肝脏  长期或超量服用扑热息痛、安乃近可影响肝功能，损害肝细胞，引起中毒性肝炎。
    损害听力  阿斯匹林等止痛药如长期服用，也可对听神经造成损害，引起耳鸣、眩晕和听力下降。
    孕妇滥用止痛药可危及胎儿  研究证实，妊娠期间滥用解热止痛药，尤其是早孕期间滥用，可危及胎儿，引起流产、畸胎。妊娠中后期大量应用，也可能造成死胎或新生儿体重过低。