婴幼儿忌过量服用  小儿正在生长发育时期，许多生理特点与成人不同，对药物的反应有明显差异，有些家长为了使病儿迅速康复，往往超量用药，从而带来诸多意想不到的后果。六神丸的治疗剂量对成人无严重不良反应，但对小儿对易引起中毒，甚至危及小儿生命。小儿及新生儿因过量服用经抢救脱险和致死的病例时有报道，应引起家长的高度重视。
    心脏病患者忌误服  六神丸的主要成分之一的“蟾酥”是一种具有强心作用的固醇混合物，其成分水解产物结构类似强心甙，会引起心律紊乱。有效成分蟾酥精的药理作用与西药的地高辛相似，而地高辛是一中效强心药，可出现强心甙中毒症状，表现为迷走神经兴奋、心肌及心血管运动中枢受损，致严重心律失常。故接受强心甙治疗病人慎用或不用六神丸。
    忌久服  六神丸所含成分大多气味芳香，辛散走窜，易耗气伤津。主要成分之一的“蟾酥”为毒性药物，而另一种主要成分“明雄黄粉”是矿物质硫化砷，毒性较大，服后可致精神萎靡、神志不清等症状，故不宜久服，以免蓄积中毒。服药剂量也应从严掌控。