认知治疗及认知行为治疗等方法已广泛用于治疗许多疾病或精神障碍，包括抑郁障碍(门诊及住院患者)、焦虑障碍(包括惊恐发作、恐怖症、广泛性焦虑症、创伤后应激障碍)、自杀及自杀企图、强迫症、精神分裂症、进食障碍(包括肥胖症、厌食症和贪食症)、睡眠障碍、人格障碍、性功能障碍及性变态、成瘾问题(包括酒精中毒)、心身疾病(如顽固性哮喘、高血压、肠易激惹综合征、慢性疼痛、癌症等)、婚姻冲突及家庭矛盾、儿童的品行及情绪障碍(如抽动症及其他病理性行为)。目前在国外有的精神科门诊中，60%的门诊精神科患者是给予认知行为治疗的。