慢性结肠炎的主要症状有：慢性腹泻或便秘，双侧腹部及双侧下腹部的纯痛或隐痛，或腹胀，大便带粘液有些伴肠鸣。以直肠炎症为主者可表现为少腹膀胱区的胀痛和尾骶部的坠胀，有时可能回误诊为泌尿系统感染、前列腺炎、盆腔炎等。