有一些体内和体外的因素会造成精子生成方面的缺陷，引发男性不孕，或引起后代的缺陷。在临床上乡岌有85%的男性不孕是属于精子的缺陷扣原因主要有： 先天性因素：如肇丸发育障碍或成熟不完全，以及染色体异常等二如可氏综合症，表现为青春期发育 延迟，阴茎能勃起和射精，但精液中没有精子，患者睾丸小，并有一80%呈现女性化，智力发育不佳，染色体为47xyzo病人塞丸多隐匿于腹腔或腹股沟内，长期处于较高温度下而使精子制造发生了障碍。内分泌疾病：如垂体、肾上腺、甲状腺的疾病引起睾丸生精功能障碍。感染因素：常见是腮腺炎引起的肇丸炎。放射线的照射：可致暂时性损害，可逆转，但需几个月甚至儿年时间。温热的影响：高温职业以及近代欧美各国流行穿紧身裤，使睾丸被压向腹股沟管，而增加睾丸温度，以致睾丸生精功能减退。 化学物质中毒及抑制生精药物的应用药物及长期大量用肇丸素、雌激素和孕激素等。长期慢性疾病及营养缺乏、肇丸损伤等引起的免疫性如发性少精症。精索静脉曲张造成的少精症。总之，随着对生殖生理研究的进展，各种物理化学因素对干扰精子发生的作用将会日渐清楚